Purtroppo Prue è stata uccisa da Shax. Piper non si rassegna e cerca di utilizzare la magia per riportarla in vita, ma invano. Duante i funerali, Cole, inseguito dagli scagnozzi della Sorgente, viene attaccato, mentre Phoebe stringendo la mano ad una ragazza ha una premonizione su di lei: verrà colpita da Shax. Lei e Cole cercano di proteggerla, ma ad un certo punto la vedono sparire comne se fosse un angelo bianco. Convocata la nonna in soffitta, le Halliwell vengono a sapere che la ragazza, Paige, è la figlia che la loro madre Patty ha avuto dal suo angelo bianco, Sam. Dopo la scoperta il potere del Trio si ricompone proprio in tempo per eliminare definitivamente Shax,ma Paige sconvolta fugge via.

La Sorgente cerca in ogni modo di ostacolare il nuovo Trio. Per fare ciò ha a disposizione 48 ore, periodo in cui una nuova strega può decidre se coltivare il Bene o scegliere il Male. Paige è sempre più confusa, la Sorgente prende addirittura il posto del suo ragazzo Shane e cerca in ogni modo di convincerla ad usare i suo i poteri a favore del male. Le Halliwell cercano la ragazza per impedirle di commettere errori, mentre l'Ispettore Cortez indaga su di loro. Paige sta quasi per cedere al fascino del male e la sorgente ferisce a morte Cole. A questo punto Paige capisce che il suo destino è il Bene ed aiuta Leo a salvare la vita di Cole.l Anche l'ispettore Cortez, salvato dall'angelo bianco, decide di non rivelare quanto ha visto. Alla fine Paige può riabbracciare sua madre.

Piper non accetta la morte di Prue ed inizia una personale lotta contro il male, aiutata da Cole e Phoebe che cercano così di proteggerla. In una di queste caccie ai demoni incappano nelle Furie che infettano Piper. Intanto Paige prende in prestito il Libro delle Ombre e non conoscendo le sie potenzialità combina diversi guai. Alla fine Cole attira a Villa Halliwell le Furie e Piper di fronte alla tomba della sorella ritorna finalmente in sè.

Cole sottopone Phoebe ad un duro allenamento perchè sia preparata all'eventuale attacco della Sorgente. Piper invece cerca di far capire a Paige i meccanismi della magia, ma questa, distratta, combina un pasticcio e scambia il suo corpo con quello di Phoebe. Yenlo, discepolo di un Mestro Zen, si vendica di lui che gli ha preferito Anling, sua figlia, come suo successore e ferito si rifugia nel Limbo. La ragazza ottiene l'aiuto delle Halliwell e nonostante la morte del Maestro, Yenlo viene sconfitto e Phoebe e Paige possono rientrare nei propri corpi.

Cole ricompare all'improvviso e scova in casa Halliwell un demone camaleontee, è chiara che la Sorgente sta tramando qualcosa. Piper inizia ad essere seper più insofferente alla magia e di ciò ne approfitta il Male. La Sorgente la rapisce cercando di convincerla che si trova in una casa di cura. Per cercare di salvarla Cole e Leo vano negli Inferi e Cole si fa catturare per avvicinarsi ilpiù possibile a Piper e proprio quando questa sta per cedere al ricatto della Sorgente Cole le infligge una dura lezione sventando così il suo diabolico piano.

Le sorelle cercano di scoprire chi sta facendo strage di steghe. In una missione, dopo aver eliminato una strana creatura, Cole chiede a Phoebe di sposarlo, ma la ragazza è titubante. Il Trio viene a contatto con Emma, una donna che sta cercando il responsabile della morte del suo fidanzato, Andrew, e Cole, vedendo il coltello che la donna ha in mano, capisce di essere stato lui. Intanto si viene a sapere che il responsabile delle recenti morti è il nuovo assistente procuratore, Sykes. Cole per affrontarlo si ritrasforma in Belthazor e lo annienta, il male però sta per avere il sopravvento su di lui quando le Halliwell usano una pozione che lo libera della parte malvagia lasciandolo senza alcun potere. Piper e Leo si trasformano per qualche ora in genitori grazie ad un bambino meccanico donatogli da Paige e capiscono che non è affatto facile.

Dopo l'ultimo scontro, la Sorgente si è indebolita e quindi chiunque può attaccarla per prenderne il posto. Uno stregone, Devlin, uilizzo l'Anello dell'Ispirazione per catturarew le Muse e servirsi di loro. Cole, ormai senza alcun potere, acquista una pistola per poter difendere Phoebe, mentre il Trio perso l'aiuto della musa Melody, catturata dallo Stregone, non sa più che fare. Alla fine però tutto torna alla normalità e il Bene ancora una volta trionfa.

Paige si sente responsabile della morte dei suoi genitori adottivi, così Leo la conduce nel passato per farle capire come effettivamente sono andate le cose. Durante l'apertura del varco temporale, due fantasmi, Frank e Lulu si impossessano dei corpi di Cole e Phoebe per compiere il loro progetto, cioè sposarsi. Nel passato Paige cerca di evitare in ogni modo la morte dei genitori, ma alla fine il loro destino si compie e lei scopre che già nel 1994 era in possesso dei suoi poteri che le avevano permesso di orbitare fuori dalla macchina in fiamme. Intanto i due fantasmi sull'altare vengono bloccati da Piper e Morris che spara a Cole. Leo arriva giusto in tempo per salvarlo e Phoebe accetta finalmente la sua proposta di matrimonio.

Il Trio protegge un ragazzino, Tyler, dotato di poteri incendiari. I suoi genitori adottivi, infatti, sono dei cacciatori di taglie che vorrebbero farlo diventare guardia del corpo della Sorgente. Piper e Leo si fingono genitori di Tyler e si recano all'Accademia dei demoni capeggiata da Ludlow. Intanto Cole da l'anello di fidanzamento di Nonna Penny a Phoebe che lentamente si trasforma nella casalinga perfetta, ricalcata sul modello di Samantha, protagonista di Vita da Strega. Paige capisce che l'anello è maledetto e rompe il sortilegio in tempo perchè il Trio possa salvare il piccolo Tyler.

La Sorgente è in pericolo, la veggente infatti ha visto le Halliwell che la eliminavano. A quel punto la sorgente rompe l'accordo tra il Bene e il Male rubando lo scrigno che contiene il vuoto, in questo modo potrebbe assorbire tutti i poteri, sia quelli buoni che cattivi. Il Male sembra trionfare, Piper e Paige perdono i loro poteri, mentre Leo viene ferito. Phoebe ha una premonizione in cui vede Cole morire, ma a malincuore accetta il suo aiuto. La veggente preoccupata per salvaguardare il futuro di tutti, buoni e cattivi, si serve dell'aiuto di Cole che assorbe il potere della Sorgente mentre il Trio trionfa. Tutto sembra essere tornato a posto, ma la Veggente sa bene che sta per arrivare la Nuova Sorgente...

Phoebe non sa più cosa fare, dentro di sè non sa se può fidarsi a fondo di Cole. Decide perciò di fare un incantesimo e così appaiono a casa Halliwell altre due Phoebe, una bimba di nove anni e una vecchia cinica che dovrebbero aiutarla a decidere se sposare Cole oppure no. L'uomo intanto è sempre più combattuto tra il bene e il male, mentre la Veggente invita il demone Kurzon ad eliminare il Trio. La vecchia Phoebe sa come andranno le cose in futuro, ma nonostante tutto sacrifica la propria vita per salvare Cole. Di fronte a questo gesto Phoebe non ha più dubbi e decide di compiere il grande passo.

Fervono i preparativi per le nozze di Phoebe che indaffarata non si rende conto che il Male si è ormai impadronito di Cole. La veggente informa l'uomo che il suo futuro figlio avrà dei poteri incredibili, ma se il matrimonio non avverrà con un rito oscuro il piccolo sceglierà la via del bene. Intanto Paige inizia a sospettare del cognato e i tarocchi le danno ragione, ma nessuno le presta attenzione. Cole cerca in ogni modo di sabotare la sua unione con Phoebe poer fare in modo che questa avvenga in un cimitero e con un prete nero, ma le sorelle riescono in extremis a rimediare. il rito ha inizio, però ancora una volta c'è un intoppo, un demone Lazzaro irrompe all'improvviso e manda all'aria tutto. Prima di essere distrutto Lazzaro addita Cole come colpevole, ma questi si trasforma nella veggente facendo credere a tutti che ogni cosa è stata escogitata dalla donna, quindi si fa ritrovare svenuto in un mausoleo. Mentre vanno via vedono una piccola cappella illuminata e decisono così di sposarsi, ma Phoebe non sa che quello che si sta compiendo è un rito nero.

Paige continua ad essere sospettosa nei confronti di Cole che ha 24 ore di tempo per concepire un bambino che sia totalmente dedito alle forze del male. Per fare ciò fa mangiare a Phoebe dei cioccolatini preparati dalla Veggente. Intanto il Trio si prende cura di Karen Young minacciata da un potere diabolico e Cole stupisce tutti annunciando di aver iniziato a lavorare per un grosso studio legale. Phoebe, Piper e Leo sono felici per lui, ma Paige continua a non fidarsi e allora Cole/La Sorgente utilizza un demone per isolarla attraverso la rabbia. La ragazza sta addirittura per soccombere e di fronte alla preoccupazione di Phoebe Cole interviene e suggerisce il modo di salvarla. Scesi negli Inferi, un demone, accortosi di avere di fronte a sè la sorgente guarisce Paige che dimentica tutto ciò che ha fatto e visto. Anche Karen si riprende, ma decide di lasciare il proprio lavoro al giornale, The Bay Mirror, a Phoebe che felice intraprende la sua nuova attività di curatrice della posta del cuore.

Improvvisamente Leo si ritrova a dover fare i conti con il proprio passato perchè due suoi vecchi amici, Rick e Nathan, ora fantasmi, vogliono vendicarsi di lui. Nel corso della battaglia di Guadalcanal Leo e i due uomini erano morti, ma questi ultimi pensano che l'angelo bianco li abbia abbandonati. Iniziano così a perseguitarlo uccidendo prima una sua protetta, Maria, e poi addirittura Piper. Leo perde i poteri e solo Paige sarà in grado di aiutarlo. Cole con l'aiuto della sua assistente Julie finalmente convince Phoebe a lasciare villa Halliwell per trasferirsi in uno splendido appartamento.

Cole/La Sorgente cerca di riunire intorno a sè le forze del male, ma la Regina dei Vampiri agisce alle sue spalle meditando di uccidere il Trio. Un suo seguace, Rowan, morde Paige che si trasforma in pipistrello. Non c'è tempo da perdere, infatti, se la ragazza dovesse a sua volta mordere un umano resterebbe vampiro per tutta la vita. A stento le sorelle la ritrovano, ma è Cole ad eliminare, non visto, la Regina e a risparmiare Paige. Ormai è chiaro che c'è una nuova forza malefica che aspira al potere e anche Piper inizia a sospettare di Cole. Phoebe intanto scopre di aspettare un bambino.

L'ultimo dei Maghi ricompare per cercare di rubare il Grimoire (il Libro delle Ombre del Male) senza cui non può esserci alcuna incoronazione. Dopo aver fallito cerca l'aiuto del Trio dicendo di volersi vendicare della Sorgente che in passato ha eliminato tutti i suoi amici maghi. Paige parla a Phoebe dei loro sospetti su Cole, ma la donna non ci crede. Solo in seguito ad una premonizione si rende conto che suo marito é malvagio, inoltre anche lei ha acquistato un potere demoniaco: lanciare fuoco dalle mani. Piper e Paige rubano il Grimoire, ma a sua volta è il Mago a trafugarlo con l'idea di poter diventare a sua volta Sorgente. Cole scopre che sta per diventare padre e per amore di Phoebe chiede al Mago di liberarlo dei suoi poteri. La Veggente però interviene e convince Phoebe a stare dalla parte di suo marito. E' la stessa Phoebe ad eliminare il Mago e a confermare alle sue sorelle la sua scelta: sarà la regina degli Inferi con l'uomo che ama.

Il Trio riceve la visita dell'Angelo del Destino che offre loro un'esistenza normale senza magia. Paige non è d'accordo, ma Piper e Phoebe vorrebbero davvero lasciarsi tutto alle spalle. Intanto Phoebe riceve una richiesta d'aiuto di Cole imprigionato in un piano astrale e con un incantesimo lo raggiunge. L'uomo è in pericolo, solo la formula della Risurrezione contenuta nel Grimoire potrebbe salvarlo, ma Phoebe non se la sente. A questo punto le Halliwell incappano in un agente dell'FBI, Jackman,che le ricatta se non lo aiuteranno a catturare Selena, una serial killer di streghe. Le tre ragazze riescono a catturare la donna, ma ben presto scoprono che è Jackman il cacciatore di streghe e riescono appena in tempo a salvare Selena già sul rogo. Jackman sta per uccidere Phoebe, ma Cole che ha nuovi diabolici poteri arriva in tempo e la salva. I poteri del Trio sono ancora utili perciò le sorelle comunicano all'Angelo del Destino la loro decisione di mantenerli. L'Angelo ne prende atto e comunica che presto Piper e Leo avranno un bambino.